Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spata18Q0P557 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spata18Q0P557 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Spata18Q0P557 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Spata18Q0P557 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spata18Q0P557 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spata18Q0P557 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spata18Q0P557 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spata18Q0P557 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Spata18Q0P557 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spata18Q0P557 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spata18Q0P557 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spata18Q0P557 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spata18Q0P557 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spata18Q0P557 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spata18Q0P557 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spata18Q0P557 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spata18Q0P557 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spata18Q0P557 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Spata18Q0P557 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spata18Q0P557 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spata18Q0P557 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spata18Q0P557 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spata18Q0P557 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spata18Q0P557 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spata18Q0P557 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spata18Q0P557 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spata18Q0P557 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spata18Q0P557 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spata18Q0P557 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spata18Q0P557 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spata18Q0P557 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spata18Q0P557 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Spata18Q0P557 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spata18Q0P557 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spata18Q0P557 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms