Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf541Q0GGX2 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms