Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
MestQ07646 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MestQ07646 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MestQ07646 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
MestQ07646 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
MestQ07646 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MestQ07646 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
MestQ07646 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MestQ07646 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
MestQ07646 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MestQ07646 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MestQ07646 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MestQ07646 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MestQ07646 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MestQ07646 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MestQ07646 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MestQ07646 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MestQ07646 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MestQ07646 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MestQ07646 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
MestQ07646 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MestQ07646 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MestQ07646 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MestQ07646 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MestQ07646 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MestQ07646 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MestQ07646 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MestQ07646 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MestQ07646 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MestQ07646 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MestQ07646 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MestQ07646 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MestQ07646 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MestQ07646 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MestQ07646 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
MestQ07646 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MestQ07646 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MestQ07646 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MestQ07646 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms