Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms