Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm37306-201ENSMUST00000193447 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Olfr434-201ENSMUST00000076752 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Mir669p-2-201ENSMUST00000103868 87 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms