Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Runx1Q03347 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms