Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddr1Q03146 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms