Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1sQ02789 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms