Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GscQ02591 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GscQ02591 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
GscQ02591 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
GscQ02591 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GscQ02591 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GscQ02591 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GscQ02591 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GscQ02591 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
GscQ02591 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GscQ02591 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GscQ02591 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GscQ02591 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GscQ02591 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GscQ02591 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GscQ02591 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GscQ02591 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GscQ02591 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GscQ02591 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GscQ02591 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GscQ02591 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GscQ02591 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
GscQ02591 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
GscQ02591 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
GscQ02591 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GscQ02591 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GscQ02591 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
GscQ02591 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GscQ02591 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GscQ02591 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GscQ02591 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
GscQ02591 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
GscQ02591 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
GscQ02591 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
GscQ02591 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
GscQ02591 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
GscQ02591 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
GscQ02591 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
GscQ02591 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
GscQ02591 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GscQ02591 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GscQ02591 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GscQ02591 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GscQ02591 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GscQ02591 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GscQ02591 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GscQ02591 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GscQ02591 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GscQ02591 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GscQ02591 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GscQ02591 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GscQ02591 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GscQ02591 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
GscQ02591 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GscQ02591 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
GscQ02591 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
GscQ02591 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
GscQ02591 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
GscQ02591 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GscQ02591 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GscQ02591 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GscQ02591 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GscQ02591 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GscQ02591 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GscQ02591 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GscQ02591 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GscQ02591 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GscQ02591 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GscQ02591 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GscQ02591 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GscQ02591 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GscQ02591 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GscQ02591 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GscQ02591 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GscQ02591 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GscQ02591 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GscQ02591 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GscQ02591 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GscQ02591 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GscQ02591 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GscQ02591 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GscQ02591 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GscQ02591 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GscQ02591 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GscQ02591 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GscQ02591 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GscQ02591 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GscQ02591 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GscQ02591 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms