Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Zfp39Q02525 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms