Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms