Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms