Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pax8Q00288 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms