Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smarcc1P97496 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcc1P97496 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms