Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme1P97371 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme1P97371 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme1P97371 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme1P97371 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme1P97371 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psme1P97371 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psme1P97371 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme1P97371 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme1P97371 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psme1P97371 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms