Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Mesp1P97309 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms