Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H3f3aP84244 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms