Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfixP70257 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfixP70257 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfixP70257 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfixP70257 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfixP70257 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfixP70257 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfixP70257 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfixP70257 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfixP70257 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NfixP70257 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfixP70257 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfixP70257 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfixP70257 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfixP70257 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfixP70257 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfixP70257 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfixP70257 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfixP70257 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfixP70257 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfixP70257 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfixP70257 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfixP70257 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfixP70257 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NfixP70257 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfixP70257 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfixP70257 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfixP70257 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfixP70257 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfixP70257 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfixP70257 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfixP70257 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfixP70257 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NfixP70257 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfixP70257 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfixP70257 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfixP70257 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfixP70257 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfixP70257 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfixP70257 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfixP70257 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfixP70257 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfixP70257 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfixP70257 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfixP70257 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfixP70257 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfixP70257 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfixP70257 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfixP70257 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfixP70257 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfixP70257 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfixP70257 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfixP70257 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfixP70257 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfixP70257 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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NfixP70257 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfixP70257 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NfixP70257 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NfixP70257 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NfixP70257 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfixP70257 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfixP70257 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfixP70257 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfixP70257 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NfixP70257 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfixP70257 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfixP70257 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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NfixP70257 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfixP70257 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfixP70257 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfixP70257 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfixP70257 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NfixP70257 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NfixP70257 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfixP70257 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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