Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
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