Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SbdsP70122 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbdsP70122 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbdsP70122 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbdsP70122 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbdsP70122 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbdsP70122 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SbdsP70122 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbdsP70122 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SbdsP70122 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SbdsP70122 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbdsP70122 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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