Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp46P62069 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp46P62069 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms