Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcmtd1P59913 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms