Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms