Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcstnP57716 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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NcstnP57716 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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NcstnP57716 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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NcstnP57716 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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NcstnP57716 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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NcstnP57716 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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NcstnP57716 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcstnP57716 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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NcstnP57716 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcstnP57716 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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NcstnP57716 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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NcstnP57716 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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NcstnP57716 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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