Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp25P57080 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp25P57080 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp25P57080 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp25P57080 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp25P57080 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp25P57080 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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