Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bace1P56818 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bace1P56818 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bace1P56818 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bace1P56818 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Bace1P56818 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bace1P56818 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Bace1P56818 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bace1P56818 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bace1P56818 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bace1P56818 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bace1P56818 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bace1P56818 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bace1P56818 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bace1P56818 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bace1P56818 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bace1P56818 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bace1P56818 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms