Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp5bP56480 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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