Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rad23bP54728 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rad23bP54728 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rad23bP54728 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rad23bP54728 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rad23bP54728 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rad23bP54728 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rad23bP54728 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rad23bP54728 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rad23bP54728 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rad23bP54728 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Rad23bP54728 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms