Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RorcP51450 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RorcP51450 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RorcP51450 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RorcP51450 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RorcP51450 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RorcP51450 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RorcP51450 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RorcP51450 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RorcP51450 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms