Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TspoP50637 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TspoP50637 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TspoP50637 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms