Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbrP50284 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbrP50284 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbrP50284 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbrP50284 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbrP50284 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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