Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc13P50207 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms