Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx1P48377 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms