Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SrprbP47758 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrprbP47758 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrprbP47758 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrprbP47758 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrprbP47758 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrprbP47758 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrprbP47758 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms