Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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TtlP38585 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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TtlP38585 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtlP38585 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtlP38585 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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TtlP38585 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtlP38585 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtlP38585 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtlP38585 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtlP38585 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtlP38585 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtlP38585 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtlP38585 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtlP38585 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtlP38585 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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TtlP38585 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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TtlP38585 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtlP38585 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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TtlP38585 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtlP38585 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtlP38585 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtlP38585 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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TtlP38585 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtlP38585 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtlP38585 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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TtlP38585 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtlP38585 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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TtlP38585 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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TtlP38585 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TtlP38585 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TtlP38585 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
TtlP38585 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TtlP38585 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TtlP38585 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TtlP38585 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TtlP38585 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TtlP38585 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtlP38585 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtlP38585 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TtlP38585 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TtlP38585 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TtlP38585 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtlP38585 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TtlP38585 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtlP38585 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms