Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab20P35295 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab20P35295 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab20P35295 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab20P35295 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab20P35295 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab20P35295 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Rab20P35295 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab20P35295 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab20P35295 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab20P35295 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rab20P35295 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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