Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VtnP29788 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VtnP29788 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VtnP29788 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VtnP29788 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VtnP29788 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VtnP29788 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VtnP29788 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VtnP29788 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VtnP29788 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
VtnP29788 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
VtnP29788 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VtnP29788 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
VtnP29788 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VtnP29788 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VtnP29788 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
VtnP29788 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VtnP29788 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VtnP29788 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VtnP29788 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
VtnP29788 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
VtnP29788 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
VtnP29788 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
VtnP29788 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
VtnP29788 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
VtnP29788 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
VtnP29788 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
VtnP29788 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
VtnP29788 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
VtnP29788 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
VtnP29788 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
VtnP29788 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
VtnP29788 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
VtnP29788 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
VtnP29788 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms