Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprmP28828 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PtprmP28828 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprmP28828 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprmP28828 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprmP28828 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprmP28828 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprmP28828 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
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PtprmP28828 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprmP28828 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprmP28828 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprmP28828 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprmP28828 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
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