Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NapbP28663 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NapbP28663 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NapbP28663 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NapbP28663 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NapbP28663 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NapbP28663 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NapbP28663 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NapbP28663 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NapbP28663 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NapbP28663 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NapbP28663 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NapbP28663 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NapbP28663 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NapbP28663 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NapbP28663 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NapbP28663 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NapbP28663 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NapbP28663 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NapbP28663 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NapbP28663 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NapbP28663 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NapbP28663 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NapbP28663 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NapbP28663 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NapbP28663 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
NapbP28663 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NapbP28663 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NapbP28663 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NapbP28663 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NapbP28663 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NapbP28663 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NapbP28663 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NapbP28663 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NapbP28663 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NapbP28663 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NapbP28663 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NapbP28663 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NapbP28663 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NapbP28663 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NapbP28663 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NapbP28663 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NapbP28663 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NapbP28663 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NapbP28663 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NapbP28663 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NapbP28663 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NapbP28663 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NapbP28663 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NapbP28663 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NapbP28663 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NapbP28663 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NapbP28663 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NapbP28663 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NapbP28663 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NapbP28663 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapbP28663 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapbP28663 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapbP28663 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapbP28663 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapbP28663 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapbP28663 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapbP28663 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapbP28663 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapbP28663 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapbP28663 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapbP28663 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NapbP28663 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapbP28663 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapbP28663 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapbP28663 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapbP28663 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapbP28663 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapbP28663 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapbP28663 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapbP28663 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapbP28663 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapbP28663 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapbP28663 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapbP28663 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms