Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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