Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CftrP26361 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CftrP26361 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CftrP26361 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CftrP26361 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CftrP26361 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CftrP26361 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CftrP26361 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CftrP26361 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CftrP26361 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CftrP26361 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CftrP26361 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CftrP26361 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CftrP26361 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CftrP26361 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CftrP26361 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CftrP26361 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CftrP26361 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CftrP26361 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CftrP26361 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CftrP26361 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CftrP26361 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CftrP26361 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CftrP26361 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CftrP26361 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CftrP26361 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CftrP26361 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CftrP26361 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CftrP26361 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CftrP26361 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CftrP26361 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CftrP26361 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CftrP26361 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CftrP26361 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CftrP26361 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CftrP26361 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CftrP26361 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CftrP26361 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CftrP26361 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CftrP26361 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CftrP26361 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CftrP26361 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CftrP26361 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CftrP26361 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CftrP26361 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CftrP26361 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CftrP26361 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CftrP26361 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CftrP26361 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CftrP26361 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CftrP26361 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CftrP26361 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CftrP26361 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CftrP26361 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CftrP26361 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CftrP26361 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CftrP26361 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CftrP26361 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CftrP26361 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CftrP26361 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CftrP26361 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CftrP26361 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CftrP26361 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CftrP26361 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CftrP26361 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CftrP26361 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CftrP26361 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CftrP26361 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CftrP26361 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CftrP26361 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CftrP26361 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CftrP26361 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CftrP26361 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CftrP26361 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CftrP26361 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CftrP26361 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CftrP26361 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CftrP26361 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CftrP26361 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CftrP26361 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CftrP26361 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CftrP26361 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CftrP26361 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CftrP26361 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CftrP26361 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CftrP26361 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CftrP26361 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CftrP26361 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CftrP26361 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CftrP26361 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CftrP26361 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CftrP26361 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CftrP26361 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CftrP26361 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CftrP26361 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CftrP26361 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CftrP26361 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CftrP26361 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CftrP26361 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CftrP26361 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms