Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3aP23116 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3aP23116 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3aP23116 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3aP23116 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3aP23116 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3aP23116 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3aP23116 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3aP23116 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eif3aP23116 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms