Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms