Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VimP20152 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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