Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NefhP19246 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NefhP19246 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NefhP19246 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NefhP19246 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NefhP19246 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NefhP19246 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NefhP19246 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NefhP19246 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NefhP19246 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NefhP19246 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NefhP19246 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NefhP19246 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NefhP19246 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NefhP19246 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NefhP19246 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NefhP19246 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NefhP19246 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NefhP19246 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NefhP19246 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NefhP19246 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NefhP19246 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NefhP19246 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NefhP19246 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NefhP19246 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NefhP19246 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NefhP19246 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NefhP19246 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NefhP19246 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NefhP19246 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NefhP19246 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NefhP19246 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NefhP19246 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NefhP19246 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NefhP19246 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NefhP19246 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NefhP19246 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NefhP19246 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NefhP19246 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NefhP19246 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NefhP19246 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NefhP19246 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NefhP19246 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NefhP19246 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NefhP19246 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NefhP19246 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NefhP19246 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NefhP19246 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NefhP19246 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NefhP19246 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NefhP19246 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NefhP19246 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NefhP19246 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NefhP19246 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NefhP19246 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NefhP19246 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NefhP19246 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NefhP19246 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NefhP19246 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NefhP19246 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NefhP19246 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NefhP19246 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NefhP19246 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NefhP19246 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NefhP19246 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NefhP19246 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NefhP19246 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NefhP19246 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NefhP19246 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NefhP19246 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NefhP19246 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NefhP19246 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NefhP19246 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NefhP19246 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NefhP19246 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NefhP19246 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NefhP19246 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NefhP19246 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NefhP19246 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NefhP19246 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NefhP19246 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NefhP19246 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NefhP19246 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NefhP19246 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NefhP19246 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NefhP19246 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NefhP19246 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NefhP19246 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NefhP19246 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NefhP19246 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NefhP19246 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NefhP19246 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NefhP19246 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NefhP19246 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NefhP19246 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NefhP19246 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NefhP19246 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NefhP19246 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NefhP19246 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NefhP19246 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms