Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18532 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18532 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18532 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18532 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18532 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18532 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18532 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18532 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P18532 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
P18532 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms