Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18530 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18530 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18530 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18530 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18530 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18530 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18530 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18530 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18530 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18530 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18530 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18530 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18530 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18530 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18530 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18530 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18530 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18530 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P18530 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18530 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18530 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18530 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18530 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18530 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18530 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18530 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18530 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18530 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18530 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18530 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18530 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P18530 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18530 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18530 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P18530 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18530 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18530 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18530 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18530 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18530 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18530 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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