Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P18529 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P18529 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P18529 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18529 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18529 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18529 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P18529 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18529 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18529 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18529 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18529 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18529 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P18529 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18529 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18529 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P18529 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18529 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18529 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18529 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P18529 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms