Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpraP18052 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpraP18052 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpraP18052 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtpraP18052 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PtpraP18052 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtpraP18052 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpraP18052 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpraP18052 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpraP18052 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpraP18052 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PtpraP18052 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms