Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcnaP17918 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcnaP17918 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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PcnaP17918 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcnaP17918 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcnaP17918 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PcnaP17918 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PcnaP17918 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcnaP17918 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms